andreas/REDCapCAST
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/agdamsbo/REDCapCAST.git synced 2026-06-19 13:17:30 +02:00
Code Issues Projects Releases Packages Wiki Activity

included shiny app with package, bslib, documentation, fixing NA bug

Browse source
This commit is contained in:
Andreas Gammelgaard Damsbo 2024-11-15 20:42:25 +01:00
commit 3cfdb66a32
21 changed files with 767 additions and 270 deletions
Download patch file Download diff file Expand all files Collapse all files

26
data/redcapcast_data.csv Normal file
View file

@ -0,0 +1,26 @@
"record_id","redcap_event_name","redcap_repeat_instrument","redcap_repeat_instance","cpr","inclusion","inclusion_time","dob","age","age_integer","sex","cohabitation","hypertension","diabetes","region","baseline_data_start_complete","mrs_assessed","mrs_date","mrs_score","mrs_complete","con_mrs","con_calc","consensus_complete","event_datetime","event_age","event_type","new_event_complete"
1,"inclusion",NA,NA,"1203401OB4",2023-03-13,12:38:49,1940-03-12,83.0023888238636,83,"female","Yes","No","Yes","East","Incomplete","Yes",2023-03-13,1,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
2,"inclusion",NA,NA,"0102342303",2023-03-01,10:38:57,1934-02-01,89.0778044723711,89,"male","Yes","No","No","South","Incomplete","Yes",2023-03-07,1,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
2,"follow1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Yes",2023-03-09,3,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
2,"follow1","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:49:42,NA,"TIA","Incomplete"
3,"inclusion",NA,NA,"2301569823",2022-03-08,12:01:07,1956-01-23,66.1231921257795,66,"male","No","Yes","Yes","North","Incomplete",NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
3,"follow1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Yes",2022-08-16,2,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
3,"follow2",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Yes",2023-03-13,1,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
3,"follow1","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:49:58,NA,"AIS","Incomplete"
3,"follow1","New Event (?)",2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:01,NA,"ICH","Incomplete"
3,"follow2","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:05,NA,"ICH","Incomplete"
3,"follow2","New Event (?)",2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:07,NA,"TIA","Incomplete"
3,"follow2","New Event (?)",3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:09,NA,"AIS","Incomplete"
4,"inclusion",NA,NA,"0204051342",2023-03-14,20:39:19,1905-04-02,117.949033861065,117,"female",NA,NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
4,"follow1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
4,"follow2",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
4,"follow1","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2001-04-11 08:39:05,96,"TIA","Complete"
4,"follow1","New Event (?)",2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2010-04-11 08:39:25,105,"TIA","Complete"
4,"follow2","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:19,118,"AIS","Complete"
4,"follow2","New Event (?)",2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:22,118,"ICH","Incomplete"
4,"follow2","New Event (?)",3,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-01-18 12:50:24,118,"Unknown","Complete"
5,"inclusion",NA,NA,"0201976043",2023-03-23,08:50:31,1897-01-02,126.21751302217,126,"male","No","Yes","Yes","East","Complete",NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
5,"follow1",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA
5,"follow1","New Event (?)",1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-04-11 09:00:33,127,"AIS","Complete"
5,"follow1","New Event (?)",2,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,2024-04-11 09:00:41,127,"ICH","Complete"
6,"inclusion",NA,NA,"1202320122",2024-01-25,08:49:28,1932-02-12,91.952606829709,91,"female","No","Yes","No","East","Complete",NA,NA,NA,"Incomplete",NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA
1 record_id redcap_event_name redcap_repeat_instrument redcap_repeat_instance cpr inclusion inclusion_time dob age age_integer sex cohabitation hypertension diabetes region baseline_data_start_complete mrs_assessed mrs_date mrs_score mrs_complete con_mrs con_calc consensus_complete event_datetime event_age event_type new_event_complete
2 1 inclusion NA NA 1203401OB4 2023-03-13 12:38:49 1940-03-12 83.0023888238636 83 female Yes No Yes East Incomplete Yes 2023-03-13 1 Incomplete NA NA NA NA NA NA NA
3 2 inclusion NA NA 0102342303 2023-03-01 10:38:57 1934-02-01 89.0778044723711 89 male Yes No No South Incomplete Yes 2023-03-07 1 Incomplete NA NA NA NA NA NA NA
4 2 follow1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Yes 2023-03-09 3 Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
5 2 follow1 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:49:42 NA TIA Incomplete
6 3 inclusion NA NA 2301569823 2022-03-08 12:01:07 1956-01-23 66.1231921257795 66 male No Yes Yes North Incomplete NA NA NA Incomplete NA NA NA NA NA NA NA
7 3 follow1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Yes 2022-08-16 2 Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
8 3 follow2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Yes 2023-03-13 1 Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
9 3 follow1 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:49:58 NA AIS Incomplete
10 3 follow1 New Event (?) 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:01 NA ICH Incomplete
11 3 follow2 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:05 NA ICH Incomplete
12 3 follow2 New Event (?) 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:07 NA TIA Incomplete
13 3 follow2 New Event (?) 3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:09 NA AIS Incomplete
14 4 inclusion NA NA 0204051342 2023-03-14 20:39:19 1905-04-02 117.949033861065 117 female NA NA NA NA Incomplete NA NA NA Incomplete NA NA NA NA NA NA NA
15 4 follow1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
16 4 follow2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
17 4 follow1 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2001-04-11 08:39:05 96 TIA Complete
18 4 follow1 New Event (?) 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2010-04-11 08:39:25 105 TIA Complete
19 4 follow2 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:19 118 AIS Complete
20 4 follow2 New Event (?) 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:22 118 ICH Incomplete
21 4 follow2 New Event (?) 3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-01-18 12:50:24 118 Unknown Complete
22 5 inclusion NA NA 0201976043 2023-03-23 08:50:31 1897-01-02 126.21751302217 126 male No Yes Yes East Complete NA NA NA Incomplete NA NA NA NA NA NA NA
23 5 follow1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Incomplete NA NA Incomplete NA NA NA NA
24 5 follow1 New Event (?) 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-04-11 09:00:33 127 AIS Complete
25 5 follow1 New Event (?) 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2024-04-11 09:00:41 127 ICH Complete
26 6 inclusion NA NA 1202320122 2024-01-25 08:49:28 1932-02-12 91.952606829709 91 female No Yes No East Complete NA NA NA Incomplete NA NA NA NA NA NA NA