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feat: introduction of validation alerts
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390
R/validation.R
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390
R/validation.R
Normal file
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@ -0,0 +1,390 @@
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# Description of warning with text description incl metric
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# Color coded (green (OK) or yellow (WARNING))
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# option to ignore/accept warnings ### to simplify things, this is gone for now ###
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# Only show warnings based on performed analyses
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## 250825
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## Works in demo
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## Not alert is printed in app interface
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## I believe it comes down to the reactivity
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############# Server and UI
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#' @title Validation module
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#'
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#' @description Check that a dataset respect some validation expectations.
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#'
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#' @param id Module's ID.
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#' @param max_height Maximum height for validation results element, useful if you have many rules.
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#' @param ... Arguments passed to \code{actionButton} or \code{uiOutput} depending on display mode,
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#' you cannot use \code{inputId}/\code{outputId}, \code{label} or \code{icon} (button only).
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#'
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#' @return
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#' * UI: HTML tags that can be included in shiny's UI
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#' * Server: a \code{list} with two slots:
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#' + **status**: a \code{reactive} function returning the best status available between \code{"OK"}, \code{"Failed"} or \code{"Error"}.
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#' + **details**: a \code{reactive} function returning a \code{list} with validation details.
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#' @export
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#'
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#' @rdname validation
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#'
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#' @example examples/validation_module_demo.R
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validation_ui <- function(id, max_height = NULL, ...) {
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ns <- shiny::NS(id)
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max_height <- if (!is.null(max_height)) {
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paste0("overflow-y: auto; max-height:", htmltools::validateCssUnit(max_height), ";")
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}
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ui <- shiny::uiOutput(
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outputId = ns("results"),
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...,
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style = max_height
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)
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htmltools::tagList(
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ui, datamods:::html_dependency_datamods()
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)
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}
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#' @export
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#'
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#' @param data a \code{reactive} function returning a \code{data.frame}.
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#'
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#' @rdname validation
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#'
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validation_server <- function(id,
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data) {
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moduleServer(
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id = id,
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module = function(input, output, session) {
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valid_ui <- reactiveValues(x = NULL)
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data_r <- if (shiny::is.reactive(data)) data else shiny::reactive(data)
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# observeEvent(data_r(), {
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# to_validate <- data()
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# valid_dims <- check_data(to_validate, n_row = n_row, n_col = n_col)
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#
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||||||
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# if (all(c(valid_dims$nrows, valid_dims$ncols))) {
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||||||
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# valid_status <- "OK"
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||||||
|
# } else {
|
||||||
|
# valid_status <- "Failed"
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# }
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||||||
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#
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||||||
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# valid_results <- lapply(
|
||||||
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# X = c("nrows", "ncols"),
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# FUN = function(x) {
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||||||
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# if (is.null(valid_dims[[x]]))
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||||||
|
# return(NULL)
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||||||
|
# label <- switch(
|
||||||
|
# x,
|
||||||
|
# "nrows" = n_row_label,
|
||||||
|
# "ncols" = n_col_label
|
||||||
|
# )
|
||||||
|
# list(
|
||||||
|
# status = ifelse(valid_dims[[x]], "OK", "Failed"),
|
||||||
|
# label = paste0("<b>", label, "</b>")
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# )
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||||||
|
# }
|
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|
# )
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|
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shiny::observeEvent(
|
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|
data_r(),
|
||||||
|
{
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||||||
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# browser()
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||||||
|
to_validate <- data_r()
|
||||||
|
if (is.reactivevalues(to_validate))
|
||||||
|
out <- lapply(
|
||||||
|
reactiveValuesToList(to_validate),
|
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|
make_validation_alerts) |>
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|
purrr::list_flatten()
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||||||
|
|
||||||
|
if (length(to_validate) > 0) {
|
||||||
|
out <- make_validation_alerts(to_validate)
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||||||
|
}
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||||||
|
valid_ui$x <- tagList(out)
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||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
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||||||
|
output$results <- renderUI({
|
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|
valid_ui$x
|
||||||
|
})
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
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|
}
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############# Validation functions
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#' Dimensions validation
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#'
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#' @param before data before
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#' @param after data after
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#' @param fun dimension function. ncol or nrow
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|
#'
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||||||
|
#' @returns data.frame
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||||||
|
#'
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||||||
|
dim_change_call <- function(before, after, fun) {
|
||||||
|
# browser()
|
||||||
|
if (!0 %in% c(dim(before), dim(after))) {
|
||||||
|
n_before <- fun(before)
|
||||||
|
n_after <- fun(after)
|
||||||
|
n_out <- n_before - n_after
|
||||||
|
p_after <- n_after / fun(before) * 100
|
||||||
|
p_out <- 100 - p_after
|
||||||
|
|
||||||
|
data.frame(
|
||||||
|
n_before = n_before,
|
||||||
|
n_after = n_after,
|
||||||
|
n_out = n_out,
|
||||||
|
p_after = p_after,
|
||||||
|
p_out = p_out
|
||||||
|
) |>
|
||||||
|
dplyr::mutate(
|
||||||
|
dplyr::across(
|
||||||
|
dplyr::where(
|
||||||
|
is.numeric
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||||||
|
),
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||||||
|
\(.y) round(.y, 0)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
data.frame(NULL)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
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#' Variable filter test wrapper
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#'
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#' @param before data before
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#' @param after data after
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#'
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#' @returns vector
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#'
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||||||
|
#' @examples
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#' vars_filter_validate(mtcars, mtcars[1:6])
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||||||
|
#' vars_filter_validate(mtcars, mtcars[0])
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||||||
|
vars_filter_validate <- function(before, after) {
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||||||
|
dim_change_call(before, after, ncol)
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||||||
|
}
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|
|
||||||
|
#' Observations filter test wrapper
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|
#'
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||||||
|
#' @param before data before
|
||||||
|
#' @param after data after
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|
#'
|
||||||
|
#' @returns vector
|
||||||
|
#'
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||||||
|
obs_filter_validate <- function(before, after) {
|
||||||
|
dim_change_call(before, after, nrow)
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||||||
|
}
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#' Validate function of missingness in data
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#'
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#' @param data data set
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#'
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|
#' @returns data.frame
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#' @export
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#'
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#' @examples
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#' df <- mtcars
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#' df[1,2:4] <- NA
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#' missings_validate(df)
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missings_validate <- function(data){
|
||||||
|
if (!0 %in% dim(data)) {
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||||||
|
# browser()
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||||||
|
p_miss <- sum(is.na(data))/prod(dim(data))*100
|
||||||
|
data.frame(
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||||||
|
p_miss = p_miss
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||||||
|
) |>
|
||||||
|
dplyr::mutate(
|
||||||
|
dplyr::across(
|
||||||
|
dplyr::where(
|
||||||
|
is.numeric
|
||||||
|
),
|
||||||
|
\(.y) signif(.y, 2)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
data.frame(NULL)
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||||||
|
}
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||||||
|
}
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||||||
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############# Collected validation functions in a library-like function
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#' Validation library
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#'
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#' @param name Index name
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#'
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#' @returns list
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||||||
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#'
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#' @examples
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#' validation_lib()
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#' validation_lib("missings")
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validation_lib <- function(name=NULL) {
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||||||
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ls <- list(
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||||||
|
"obs_filter" = function(x, y) {
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||||||
|
## Validation function for observations filter
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||||||
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list(
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||||||
|
string = i18n$t("You removed {p_out} % of observations."),
|
||||||
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summary.fun = obs_filter_validate,
|
||||||
|
summary.fun.args = list(
|
||||||
|
before = x,
|
||||||
|
after = y
|
||||||
|
),
|
||||||
|
test.fun = function(x, var, cut) {
|
||||||
|
test.var <- x[var]
|
||||||
|
ifelse(test.var > cut, "warning", "succes")
|
||||||
|
},
|
||||||
|
test.fun.args = list(var = "p_out", cut = 50)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"var_filter" = function(x, y) {
|
||||||
|
## Validation function for variables filter
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||||||
|
list(
|
||||||
|
string = i18n$t("You removed {p_out} % of variables."),
|
||||||
|
summary.fun = vars_filter_validate,
|
||||||
|
summary.fun.args = list(
|
||||||
|
before = x,
|
||||||
|
after = y
|
||||||
|
),
|
||||||
|
test.fun = function(x, var, cut) {
|
||||||
|
test.var <- x[var]
|
||||||
|
ifelse(test.var > cut, "warning", "succes")
|
||||||
|
},
|
||||||
|
test.fun.args = list(var = "p_out", cut = 50)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"missings" = function(x, y) {
|
||||||
|
### Placeholder for missingness validation
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||||||
|
list(
|
||||||
|
string = "There are {p_miss} % missing observations.",
|
||||||
|
summary.fun = missings_validate,
|
||||||
|
summary.fun.args = list(
|
||||||
|
data = x
|
||||||
|
),
|
||||||
|
test.fun = function(x, var, cut) {
|
||||||
|
test.var <- x[var]
|
||||||
|
ifelse(test.var > cut, "warning", "succes")
|
||||||
|
},
|
||||||
|
test.fun.args = list(var = "p_miss", cut = 30)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
if (!is.null(name)){
|
||||||
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name <- match.arg(name,choices = names(ls))
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||||||
|
ls[[name]]
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||||||
|
} else {
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||||||
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ls
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||||||
|
}
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||||||
|
}
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||||||
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||||||
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||||||
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########################################################################
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############# Validation creation
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#' Create validation data.frame
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#'
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||||||
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#' @param ls validation list
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|
#' @param ... magic dots
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#'
|
||||||
|
#' @returns data.frame
|
||||||
|
#' @export
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||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @examples
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||||||
|
#' i18n <- shiny.i18n::Translator$new(translation_csvs_path = here::here("inst/translations"))
|
||||||
|
#' i18n$set_translation_language("en")
|
||||||
|
#' df_original <- mtcars
|
||||||
|
#' df_original[1,2:4] <- NA
|
||||||
|
#' df_obs <- df_original |> dplyr::filter(carb==4)
|
||||||
|
#' df_vars <- df_original[1:7]
|
||||||
|
#' val <- purrr::map2(
|
||||||
|
#' .x = validation_lib(),
|
||||||
|
#' .y = list(
|
||||||
|
#' list(x = df_original, y = df_obs),
|
||||||
|
#' list(x = df_original, y = df_vars),
|
||||||
|
#' list(x=df_original)),
|
||||||
|
#' make_validation
|
||||||
|
#' )
|
||||||
|
#' val |> make_validation_alerts()
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' val2 <- purrr::map2(
|
||||||
|
#' .x = validation_lib()[2],
|
||||||
|
#' .y = list(list(x = mtcars, y = mtcars[0])),
|
||||||
|
#' make_validation
|
||||||
|
#' )
|
||||||
|
#' val2 |> make_validation_alerts()
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' val3 <- make_validation(
|
||||||
|
#' ls = validation_lib()[[2]],
|
||||||
|
#' list(x = mtcars, y = mtcars[0])
|
||||||
|
#' )
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||||||
|
make_validation <- function(ls, ...) {
|
||||||
|
ls <- do.call(ls, ...)
|
||||||
|
|
||||||
|
df <- do.call(ls$summary.fun, ls$summary.fun.args)
|
||||||
|
|
||||||
|
if (!any(dim(df) == c(0))) {
|
||||||
|
label <- with(df, {
|
||||||
|
glue::glue(ls$string)
|
||||||
|
})
|
||||||
|
|
||||||
|
# browser()
|
||||||
|
status <- do.call(ls$test.fun, modifyList(ls$test.fun.args, list(x = df)))
|
||||||
|
|
||||||
|
data.frame(
|
||||||
|
label = label,
|
||||||
|
status = status[1]
|
||||||
|
)
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
data.frame(NULL)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#' Create alert from validation data.frame
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @param data
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @export
|
||||||
|
make_validation_alerts <- function(data) {
|
||||||
|
# browser()
|
||||||
|
if (is.data.frame(data)){
|
||||||
|
ls <- list(data)
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
ls <- data
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
lapply(
|
||||||
|
X = ls,
|
||||||
|
FUN = function(x) {
|
||||||
|
# browser()
|
||||||
|
if (!is.null(dim(x)) && !any(dim(x) == c(0))) {
|
||||||
|
icon <- switch(x$status,
|
||||||
|
"succes" = phosphoricons::ph("check", title = "OK"),
|
||||||
|
"warning" = phosphoricons::ph("warning", title = "Warning")
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
shinyWidgets::alert(
|
||||||
|
icon,
|
||||||
|
htmltools::HTML(x$label),
|
||||||
|
status = x$status,
|
||||||
|
style = "margin-bottom: 10px; padding: 10px;"
|
||||||
|
)
|
||||||
|
} else {
|
||||||
|
return(NULL)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
}
|
||||||
133
examples/validation_module_demo.R
Normal file
133
examples/validation_module_demo.R
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,133 @@
|
||||||
|
#' Data and analyses validation demo
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @returns
|
||||||
|
#' @export
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @examples
|
||||||
|
#' \dontrun{
|
||||||
|
#' validation_demo_app()
|
||||||
|
#' }
|
||||||
|
validation_demo_app <- function() {
|
||||||
|
ui <- shiny::fluidPage(
|
||||||
|
shiny::tags$h2("Validation"),
|
||||||
|
IDEAFilter::IDEAFilter_ui("data_filter"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
DT::DTOutput("data_final"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_2")
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
server <- function(input, output, session) {
|
||||||
|
rv <- shiny::reactiveValues(
|
||||||
|
data_original = shiny::reactive(mtcars),
|
||||||
|
data_filtered = NULL
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
rv_validation <- shiny::reactiveValues(
|
||||||
|
obs_filter = NULL,
|
||||||
|
vars_filter = NULL
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
data_filter <- IDEAFilter::IDEAFilter(
|
||||||
|
id = "data_filter",
|
||||||
|
data = mtcars,
|
||||||
|
verbose = TRUE
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
shiny::observeEvent(
|
||||||
|
data_filter(),
|
||||||
|
{
|
||||||
|
rv$data_filtered <- data_filter()
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
output$data_final <- DT::renderDT(
|
||||||
|
data_filter()
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
shiny::observeEvent(
|
||||||
|
list(
|
||||||
|
data_filter()
|
||||||
|
),
|
||||||
|
{
|
||||||
|
to_make_validation <- data_filter()
|
||||||
|
## Validation
|
||||||
|
if (!is.null(to_make_validation)) {
|
||||||
|
validation <-
|
||||||
|
make_validation(
|
||||||
|
ls = validation_lib("obs_filter"),
|
||||||
|
list(
|
||||||
|
x = mtcars,
|
||||||
|
y = to_make_validation
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
rv_validation$vars_filter <- validation
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_2", data = rv_validation$vars_filter)
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
# shiny::observeEvent(
|
||||||
|
# list(
|
||||||
|
# shiny::reactive(rv_validation$vars_filter)(),
|
||||||
|
# data_filter()
|
||||||
|
# ),
|
||||||
|
# {
|
||||||
|
# # browser()
|
||||||
|
# # to_make_alert <- shiny::isolate(rv_validation$vars_filter)
|
||||||
|
# to_make_alert <- shiny::reactive(rv_validation$vars_filter)()
|
||||||
|
# if (!is.null(rv_validation$vars_filter)) {
|
||||||
|
# validation_server(id = "validation_demo_2", data = to_make_alert)
|
||||||
|
# }
|
||||||
|
# }
|
||||||
|
# )
|
||||||
|
}
|
||||||
|
shiny::shinyApp(ui, server)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
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||||||
|
|
||||||
|
#' Title
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @returns
|
||||||
|
#' @export
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @examples
|
||||||
|
#' validation_nr_demo_app()
|
||||||
|
validation_nr_demo_app <- function() {
|
||||||
|
ui <- shiny::fluidPage(
|
||||||
|
shiny::tags$h2("Validation"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_1", max_height = "30px"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_2")
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
server <- function(input, output, session) {
|
||||||
|
df_original <- mtcars
|
||||||
|
|
||||||
|
df_obs <- mtcars |> dplyr::filter(mpg > 20)
|
||||||
|
|
||||||
|
df_vars <- df_obs[1:6]
|
||||||
|
|
||||||
|
val1 <- purrr::map2(
|
||||||
|
.x = validation_lib()[1],
|
||||||
|
.y = list(list(x = df_original, y = df_obs)),
|
||||||
|
make_validation
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
val2 <- make_validation(
|
||||||
|
ls = validation_lib()[[2]],
|
||||||
|
list(x = df_original, y = df_vars)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_1", data = val1)
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_2", data = val2)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
shiny::shinyApp(ui, server)
|
||||||
|
}
|
||||||
169
man/validation.Rd
Normal file
169
man/validation.Rd
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,169 @@
|
||||||
|
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
|
||||||
|
% Please edit documentation in R/validation.R
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||||||
|
\name{validation_ui}
|
||||||
|
\alias{validation_ui}
|
||||||
|
\alias{validation_server}
|
||||||
|
\title{Validation module}
|
||||||
|
\usage{
|
||||||
|
validation_ui(id, max_height = NULL, ...)
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id, data)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\arguments{
|
||||||
|
\item{id}{Module's ID.}
|
||||||
|
|
||||||
|
\item{max_height}{Maximum height for validation results element, useful if you have many rules.}
|
||||||
|
|
||||||
|
\item{...}{Arguments passed to \code{actionButton} or \code{uiOutput} depending on display mode,
|
||||||
|
you cannot use \code{inputId}/\code{outputId}, \code{label} or \code{icon} (button only).}
|
||||||
|
|
||||||
|
\item{data}{a \code{reactive} function returning a \code{data.frame}.}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\value{
|
||||||
|
\itemize{
|
||||||
|
\item UI: HTML tags that can be included in shiny's UI
|
||||||
|
\item Server: a \code{list} with two slots:
|
||||||
|
\itemize{
|
||||||
|
\item \strong{status}: a \code{reactive} function returning the best status available between \code{"OK"}, \code{"Failed"} or \code{"Error"}.
|
||||||
|
\item \strong{details}: a \code{reactive} function returning a \code{list} with validation details.
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\description{
|
||||||
|
Check that a dataset respect some validation expectations.
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|
}
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|
\examples{
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||||||
|
#' Data and analyses validation demo
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|
#'
|
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|
#' @returns
|
||||||
|
#' @export
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @examples
|
||||||
|
#' \dontrun{
|
||||||
|
#' validation_demo_app()
|
||||||
|
#' }
|
||||||
|
validation_demo_app <- function() {
|
||||||
|
ui <- shiny::fluidPage(
|
||||||
|
shiny::tags$h2("Validation"),
|
||||||
|
IDEAFilter::IDEAFilter_ui("data_filter"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
DT::DTOutput("data_final"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_2")
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
server <- function(input, output, session) {
|
||||||
|
rv <- shiny::reactiveValues(
|
||||||
|
data_original = shiny::reactive(mtcars),
|
||||||
|
data_filtered = NULL
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
rv_validation <- shiny::reactiveValues(
|
||||||
|
obs_filter = NULL,
|
||||||
|
vars_filter = NULL
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
data_filter <- IDEAFilter::IDEAFilter(
|
||||||
|
id = "data_filter",
|
||||||
|
data = mtcars,
|
||||||
|
verbose = TRUE
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
shiny::observeEvent(
|
||||||
|
data_filter(),
|
||||||
|
{
|
||||||
|
rv$data_filtered <- data_filter()
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
output$data_final <- DT::renderDT(
|
||||||
|
data_filter()
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
shiny::observeEvent(
|
||||||
|
list(
|
||||||
|
data_filter()
|
||||||
|
),
|
||||||
|
{
|
||||||
|
to_make_validation <- data_filter()
|
||||||
|
## Validation
|
||||||
|
if (!is.null(to_make_validation)) {
|
||||||
|
validation <-
|
||||||
|
make_validation(
|
||||||
|
ls = validation_lib("obs_filter"),
|
||||||
|
list(
|
||||||
|
x = mtcars,
|
||||||
|
y = to_make_validation
|
||||||
|
)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
rv_validation$vars_filter <- validation
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_2", data = rv_validation$vars_filter)
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
}
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
# shiny::observeEvent(
|
||||||
|
# list(
|
||||||
|
# shiny::reactive(rv_validation$vars_filter)(),
|
||||||
|
# data_filter()
|
||||||
|
# ),
|
||||||
|
# {
|
||||||
|
# # browser()
|
||||||
|
# # to_make_alert <- shiny::isolate(rv_validation$vars_filter)
|
||||||
|
# to_make_alert <- shiny::reactive(rv_validation$vars_filter)()
|
||||||
|
# if (!is.null(rv_validation$vars_filter)) {
|
||||||
|
# validation_server(id = "validation_demo_2", data = to_make_alert)
|
||||||
|
# }
|
||||||
|
# }
|
||||||
|
# )
|
||||||
|
}
|
||||||
|
shiny::shinyApp(ui, server)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
#' Title
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @returns
|
||||||
|
#' @export
|
||||||
|
#'
|
||||||
|
#' @examples
|
||||||
|
#' validation_nr_demo_app()
|
||||||
|
validation_nr_demo_app <- function() {
|
||||||
|
ui <- shiny::fluidPage(
|
||||||
|
shiny::tags$h2("Validation"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_1", max_height = "30px"),
|
||||||
|
shiny::br(),
|
||||||
|
validation_ui("validation_demo_2")
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
server <- function(input, output, session) {
|
||||||
|
df_original <- mtcars
|
||||||
|
|
||||||
|
df_obs <- mtcars |> dplyr::filter(mpg > 20)
|
||||||
|
|
||||||
|
df_vars <- df_obs[1:6]
|
||||||
|
|
||||||
|
val1 <- purrr::map2(
|
||||||
|
.x = validation_lib()[1],
|
||||||
|
.y = list(list(x = df_original, y = df_obs)),
|
||||||
|
make_validation
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
val2 <- make_validation(
|
||||||
|
ls = validation_lib()[[2]],
|
||||||
|
list(x = df_original, y = df_vars)
|
||||||
|
)
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_1", data = val1)
|
||||||
|
|
||||||
|
validation_server(id = "validation_demo_2", data = val2)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
shiny::shinyApp(ui, server)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
21
man/validation_lib.Rd
Normal file
21
man/validation_lib.Rd
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,21 @@
|
||||||
|
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
|
||||||
|
% Please edit documentation in R/validation.R
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||||||
|
\name{validation_lib}
|
||||||
|
\alias{validation_lib}
|
||||||
|
\title{Validation library}
|
||||||
|
\usage{
|
||||||
|
validation_lib(name = NULL)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\arguments{
|
||||||
|
\item{name}{Index name}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\value{
|
||||||
|
list
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\description{
|
||||||
|
Validation library
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\examples{
|
||||||
|
validation_lib()
|
||||||
|
validation_lib("missings")
|
||||||
|
}
|
||||||
23
man/vars_filter_validate.Rd
Normal file
23
man/vars_filter_validate.Rd
Normal file
|
|
@ -0,0 +1,23 @@
|
||||||
|
% Generated by roxygen2: do not edit by hand
|
||||||
|
% Please edit documentation in R/validation.R
|
||||||
|
\name{vars_filter_validate}
|
||||||
|
\alias{vars_filter_validate}
|
||||||
|
\title{Variable filter test wrapper}
|
||||||
|
\usage{
|
||||||
|
vars_filter_validate(before, after)
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\arguments{
|
||||||
|
\item{before}{data before}
|
||||||
|
|
||||||
|
\item{after}{data after}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\value{
|
||||||
|
vector
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\description{
|
||||||
|
Variable filter test wrapper
|
||||||
|
}
|
||||||
|
\examples{
|
||||||
|
vars_filter_validate(mtcars, mtcars[1:6])
|
||||||
|
vars_filter_validate(mtcars, mtcars[0])
|
||||||
|
}
|
||||||
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